一些组织内含有骨质或钙化灶时，含钙的组织不宜直接用石蜡包埋切片。这是因为钙和石蜡之间的密度不同，较难切除完整的切片。对含钙组织*固定之后，再进行脱钙或二者同时进行。然后进行下游的实验，如脱水、透明、浸蜡、包埋、切片。用于脱钙的试剂很多，脱钙剂包括有机酸、 无机酸以及电解法脱钙。

       在脱钙的过程中，应每隔一段时间检测一次脱钙程度，避免脱钙过度。脱钙过度会增加组织的 损伤程度，进而影响染色结果。